En tu caso, ¿ninguno de los dos nodos pueden arrancar de forma independiente al otro?

Quizá tu actual configuración de la replicación de las tablas de la base de datos Mnesia hace que un nodo dependa del otro, y viceversa.

Pero estoy casi seguro que es posible configurar que un nodo pueda arrancar correctamente, sin importar que sus tablas estén replicadas (o no) en otro nodo (o nodos). A menudo tal nodo es el primero que instalaste, en el cual NO tocaste la configuración de Mnesia, y que podemos considerar nodo 'maestro'.

Si compruebas que en tu caso actual los nodos son interdependientes, puedes probar esto:
1. Para ambos nodos
2. Borra los directorios Mnesia de ambos nodos
3. Inicia el primer nodo.
4. Inicia el segundo nodo como dice la Guide para configurar que se replique del primero, pero solo configura unas pocas tablas.
5. Comprueba que los nodos funcionan bien conectados.
6. Ahora comprueba que el primer nodo puede funcionar sin necesidad de que el segundo esté iniciado.